Gamtos tyrimų centro herbariumas (tarptautinis indeksas – BILAS) įkurtas 1948 m. Šiuo metu herbariumą sudaro: 1) Lietuvos induočių augalų herbariumas (apie 95 000 pavyzdžių), 2) bendrasis užsienio kraštų augalų herbariumas (apie 6000 pavyzdžių), 3) Lietuvos samanų herbariumas (apie 25 000 pavyzdžių), 4) makromicetų herbariumas (apie 60 000 pavyzdžių), 5) mikromicetų herbariumas (apie 12 000 pavyzdžių), 6) miksomicetų herbariumas (apie 4000 pavyzdžių), 7) kerpių ir su jomis susijusių grybų herbariumas (apie 10 000 pavyzdžių). Herbariume saugomi žymiausio Lietuvos floros tyrėjo prof. P. Snarskio rinkiniai (apie 12 000 herbariuminių lapų).
Induočių augalų rinkinių informacija įskaitmeninta (duomenų bazės pagrindas – BRAHMS programinė įranga), o tyrėjai gali naudotis šiuolaikine mikroskopavimo ir vaizdų dokumentavimo įranga.
Herbariumo pavyzdžiai saugomi kontroliuojamo klimato patalpose, kuriose tuo pat metu užtikrinama apsauga nuo kenkėjų ir mechaninio poveikio.
Gamtos tyrimų centro herbariumas teikia paslaugas valstybinėms ir privačioms institucijoms: inseruoja ir saugo herbariumo pavyzdžius; paruošia ir priima saugoti ilgą laiką augalų ir grybų pavyzdžius, kurie buvo panaudoti kaip MTEP objektai; teikia informaciją apie saugomus pavyzdžius, vykdo duomenų mainus su kitų šalių herbariumais.
