Įrenginio modelis
QuantStudio 5
Gamintojas
Carlsbad, CA, JAV
Paskirtis
DNR kiekybiškai ir kokybiškai nustatyti, DNR amplifikacijai stebėti realiu laiku. Sistemą galima naudoti kaip konvencinį PGR prietaisą arba fluorescencijos detektorių. Prietaisu atliekami šie molekuliniai tyrimai:
• multipleksinių reakcijų atlikimas, naudojant penkis skirtingus kanalus;
• kiekybinė ir kokybinė genų ekspresijos analizė;
• bakterijų, virusų ir kitokios kilmės DNR arba RNR kiekybinis įvertinimas;
• NGS bibliotekų kiekio nustatymas;
• SNP genotipų analizė;
• translokacijų analizė;
• mikroRNR ekspresijos tyrimai;
• genetinis kartografavimas;
• palyginamoji CT analizė.
Techniniai parametrai
• Reakcijos blokas – 96 šulinėlių, 0,2 ml.
• Naudojamos standartinio profilio plokštelės be rėmelio arba pusiau su rėmeliu arba mėgintuvėlių juostelės.
• Rekomenduojamas reakcijos tūris – 10–50 µl.
• Temperatūros intervalas – nuo 4 iki 99,9 °C. Šiame intervale galimas 6 zonų temperatūros gradientas, maksimaliai apimantis 30 °C (ne daugiau kaip 5 °C skirtumas tarp gretimų zonų).
• Didžiausias reakcijų skaičius viename šulinėlyje (multiplex) – 5.
• Detekcijos kanalų fluorescencijos sužadinimo ir detekcijos intervalai:
sužadinimas 470 ± 15 nm, detekcija 520 ± 15 nm;
sužadinimas 520 ± 10 nm, detekcija 558 ± 12 nm;
sužadinimas 550 ± 10 nm, detekcija 587 ± 10 nm;
sužadinimas 580 ± 10 nm, detekcija 623 ± 14 nm;
sužadinimas 640 ± 10 nm, detekcija 682 ± 14 nm;
sužadinimas 662 ± 10 nm, detekcija 711 ± 12 nm.
• Prietaisas gali dirbti su šiais dažais: SYBR Green, EvaGreen, FAM, VIC, JOE, HEX, CAL Fluor 540, CAL Fluor Orange 560, TAMRA, Cy3, ROX, TEX 615,CAL Fluor Red 610,Cy5, Quasar 670, Liz, Mustang Purple, Cy5.5, Quasar 705.
• Programinė įranga apima šiuos analizės metodus:
absoliuti genų ekspresija su standartine kreive;
santykinė genų ekspresija su standartine kreive;
santykinė genų ekspresija 2-ΔΔCT metodu;
genotipavimas;
buvimas / nebuvimas.
Padalinys
Augalų fiziologijos laboratorija
