- 
                            
                                2015-2018 m.Skirtingų medžių rūšių ir besiformuojančių miško bendrijų atsakas ir plastiškumas klimato kaitos ir kitų streso veiksnių poveikyje (MIŠKOEKOKAITA) Projekto vadovai: dr. Jurga Jankauskienė ir dr. Juozas Labokas 
 Padalinys: Augalų fiziologijos laboratorija ir Ekonominės botanikos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Agro-, miško ir vandens ekosistemų tvarumas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2015-2018 m.Rūšinės ir funkcinės įvairovės reikšmė vandens ekosistemų paslaugoms didėjant eutrofikacijai ir cheminei taršai (RETRO) Projekto vadovas: prof. dr. Kęstutis Arbačiauskas 
 Padalinys: Hidrobiontų evoliucinės ekologijos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Agro-, miško ir vandens ekosistemų tvarumas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2015-2018 m.Agroekosistemų mikrobiota klimato kaitos sąlygomis: struktūra ir dermės mechanizmai (AMIKUS) Projekto vadovė: prof. dr. Elena Servienė 
 Padalinys: Genetikos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Agro-, miško ir vandens ekosistemų tvarumas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2012-2015 m.Antimikrobiškai aktyvių pieno rūgšties bakterijų filogenetinė analizė ir atranka raugų gamybai (PIENRUGBANKT) Projekto vadovas: dr. Jūratė Repečkienė 
 Padalinys: Biodestruktorių tyrimo laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Sveikas ir saugus maistas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2014-2015 m.Biomarkerių paieška kenksmingų medžiagų aptikimui grūduose ir jų produktuose kokybės bei saugos kontrolei (MIKOTOX) Projekto vadovė: dr. Rita Butkienė 
 Padalinys: Cheminės ekologijos ir elgsenos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Sveikas ir saugus maistas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2013-2015 m.Bakteriocinų kaip biokonservantų mikrokapsuliavimo tyrimai (BAKTERIOCINAI) Projekto vadovė: prof. dr. Elena Servienė 
 Padalinys: Genetikos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Sveikas ir saugus maistas“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2012-2014 m.Bičių, Apis mellifera, svetimkraščių ligų sukėlėjų aptikimas ir plitimo Lietuvoje dėsningumai (VIRUSAI) Projekto vadovė: dr. Sandra Radžiutė 
 Padalinys: Cheminės ekologijos ir elgsenos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2012-2014 m.Didžiųjų kormoranų kolonija miško ekosistemoje – hipertrofikacijos poveikis ir dinamikos tempai (KOREKO) Projekto vadovė: dr. Jurga Motiejūnaitė 
 Padalinys: Mikologijos laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2012-2014 m.Kvartero šiltmečių paleoaplinkos pokyčių cikliškumas, dinamika ir kaitos modeliai (CIKLAS) Projekto vadovas: habil. dr. Valentinas Baltrūnas 
 Padalinys: Kvartero tyrimų laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba
- 
                            
                                2012-2014 m.Paleoaugalijos ekspansija ekosistemos dinamikos kontekste rytų Baltijos regione poledynmetyje (PALEOAUGALIJA) Projekto vadovė: dr. Miglė Stančikaitė 
 Padalinys: Kvartero tyrimų laboratorija
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba