Laboratorijos vadovas, vyriausiasis mokslo darbuotojas
Integruotas vandens valdymas Lietuvoje (LIFE SIP VANDUO)GTC vykdomos projekto dalies vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: Europos Komisija  
Šylantis klimatas ir vidutinių platumų ežerų ateitis: mitybos tinklo virsmai Drūkšių ežere (aušinimo rezervuare) paleidus ir sustabdžius atominę elektrinę.Projekto vadovas: dr. Vytautas Rakauskas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Žuvų migracijos per Kauno A. Brazausko hidroelektrinę galimybių analizės studijaProjekto vadovas: dr. Justas Dainys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Ignitis gamyba“ 
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimo ir Kruonio HAE viršutinio baseino žuvų populiacijos įvertinimo studijosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Ignitis gamyba“ 
Įveistų ungurių neršto migracijos įvertinimas ir rekomendacijų dėl tolesnių veiksmų įgyvendinant Lietuvos ungurių išteklių valdymo planą pateikimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Ungurių populiacijos būklės ir ungurių valdymo plano Lietuvoje veiksmingumo įvertinimo 2018-2023 m. paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Žuvų išteklių įvertinimo valstybiniuose vidaus vandens telkiniuose 2023-2025 m., žuvų išteklių naudojimo ir atkūrimo planų 2023-2028 m. parengimo paslaugų pirkimo sutartis paslaugosProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos aplinkos ministerija 
Praeivių lašišinių žuvų (lašišos, šlakio) ir kiršlio jauniklių, rituolių ir nerštaviečių monitoringas bei būklės įvertinimas Rytų Lietuvos upėseProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Sterlių įveisimo darbų Nemuno vidurupyje efektyvumo įvertinimas ir rekomendacijų dėl tolesnių įveisimo darbų plėtros parengimas Projekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos  
Ichtiofaunos ir vandens floros (makrofitų ir fitobentoso) tyrimų paslaugosProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Praeivių lašišinių žuvų (lašišos, šlakio) ir kiršlio jauniklių, rituolių ir nerštaviečių monitoringas bei būklės įvertinimas Rytų Lietuvos upėseProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Praeivių lašišinių žuvų (lašišos, šlakio) ir kiršlio jauniklių, rituolių ir nerštaviečių monitoringas bei būklės įvertinimas Rytų Lietuvos upėseProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Žuvų rūšinės sudėties ir ekologinės būklės pagal žuvų rodiklius įvertinimas Mažojo Gulbino ežereProjekto vadovas: dr. Justas Dainys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: MB „Scientia practica“ 
Europos Bendrijos svarbos žuvų rūšių palankios apsaugos būklės kriterijų parengimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Valstybinė saugomų teritorijų tarnyba prie Lietuvos Respublikos aplinkos ministerijos 
KHE tvenkinio vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms įvertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Ignitis gamyba“ 
Praeivių lašišinių žuvų (lašišos, šlakio) ir kiršlio jauniklių, rituolių ir nerštaviečių monitoringas bei būklės įvertinimas Rytų Lietuvos upėseProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Inkaruojamų marinių gaudyklių žuvų priegaudos mažinimas Kuršių marių žvejybojeProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Joint management of Latvian – Lithuanian transboundary river and lake water bodies (TRANSWAT)Projekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: Europos Sąjunga/Europos regioninės plėtros fondas 
Europinių ungurių populiacijos išteklių atstatymo ir būklės monitoringo tyrimų paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos   
Ungurių įveisimo efektyvumo vertinimas, stebint įveistų ungurių išgyvenimą, apsikrėtimą parazitais, augimo tempus, lyčių santykįProjekto vadovas: dr. Justas Dainys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Rekomendacijų dėl aštriašnipių eršketų populiacijos atkūrimo Lietuvoje 2021–2025 metais programos parengimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Nemuno deltos atšakų (upių) gilinimo projekto galimybių studijos parengimasProjekto vadovas: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos  
Vandens lygio svyravimo poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE įvertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Lietuvos Baltijos jūros aplinkos apsaugos valdymo stiprinimo dokumentų (būklės vertinimo) atnaujinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Praeivių žuvų populiacijos būklės 2019 m. Rytų Lietuvos upėse ištyrimas ir įvertinimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Europos Bendrijos svarbos žuvų ir nėgių rūšių, išskyrus lašišų, kurių apsaugai būtina steigti teritorijas, monitoringo 2019 metų plano įgyvendinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Žemės ūkio, maisto ūkio ir žuvininkystės 2015–2020 metų mokslinių tyrimų ir taikomosios veiklos projekto vykdymas. Rekomendacijų dėl žuvų ženklinimo metodų parinkimo ir žuvų įveisimo efektyvumo vertinimo metodikos parengimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Europinių ungurių (sidabrinio ungurio stadijos) mirtingumo migruojant Lietuvos vidaus vandenyse vertinimas naudojant akustinius bei telemetrinius metodus 2019–2021 metaisProjekto vadovai: dr. Justas Dainys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Baltijos jūros priekrantės ichtiofaunos tyrimų 2019–2021 metais bei ekologinės būklės pagal žuvų rodiklius vertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Žuvų išteklių įvertinimo valstybiniuose vidaus vandens telkiniuose 2019–2021 m. paslaugosProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos aplinkos ministerija 
Europos Bendrijos svarbos žuvų rūšių: ežerinės rainės (Rhynchocypris percnurus), paprastojo kirtiklio (Cobitis taenia) ir auksaspalvio kirtiklio (Sabanejewia baltica) inventorizacijos paslaugosProjekto vadovas: dr. Vytautas Rakauskas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Valstybinė saugomų teritorijų tarnyba prie Lietuvos Respublikos aplinkos ministerijos 
Kuršių marių žuvų išteklių tyrimų ir rekomendacijų dėl žuvų išteklių racionalaus naudojimo ir saugomų žuvų šalutinio laimikio sumažinimo pateikimo 2019–2021 m. paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos aplinkos ministerija  
Europinių ungurių populiacijos išteklių atstatymo ir būklės monitoringo tyrimų paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos   
CA18102	The European aquatic animal tracking networkValdymo komiteto narys: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: COST 
Miesto antropogeninės taršos įtaka vandens mikrobiotos struktūrai:metagenomo analizėProjekto vadovė: dr. Vesta Skrodenytė-Arbačiauskienė
Stintų nerštinės migracijos, žuvų pavasarinės ir rudeninės migracijų intensyvumo stebėjimų Klaipėdos valstybinio jūrų uosto akvatorijoje 2018 m. kasimo darbų metuProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: VĮ Klaipėdos valstybinio jūrų uosto direkcija 
KHE tvenkinio vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms įvertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Praeivių žuvų populiacijos būklės 2018 m. Rytų Lietuvos upėse ištyrimas ir įvertinimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Žemės ūkio, maisto ūkio ir žuvininkystės 2015–2020 metų mokslinių tyrimų ir taikomosios veiklos projekto vykdymas. Rekomendacijų dėl žuvų gaudyklių naudojimo priekrantės žvejyboje parengimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Baltijos jūros priekrantės ichtiofaunos tyrimų 2018 metais bei ekologinės būklės pagal žuvų rodiklius vertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Žuvų išteklių įvertinimo valstybiniuose vidaus vandens telkiniuose, žuvų išteklių naudojimo ir atkūrimo planų 2017–2021 m. parengimasProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos aplinkos ministerija 
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Pasvalio miesto tvenkinyje ir Lėvens upėje žemiau Pasvalio miesto tvenkinio 2017–2018 metais atliekami fizikinių-cheminių rodiklių, floros ir faunos tyrimai bei nustatoma minėtų vandens telkinių būklėProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Pasvalio rajono savivaldybės administracija 
Rekomendacijų dėl nuostolių, patirtų netekus galimybės žvejoti dėl kitų asmenų veiklos, kompensavimo parengimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerija 
Kuršių marių žuvų išteklių tyrimų ir rekomendacijų dėl žuvų išteklių racionalaus naudojimo ir saugomų žuvų šalutinio laimikio sumažinimo pateikimo 2016–2018 m. paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos Respublikos aplinkos ministerija 
Praeivių žuvų populiacijos būklės 2017 m. Lietuvos upėse ištyrimo ir įvertinimo paslaugos atlikimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
Collecting of fish samples in Lithuanian lakes and rivers for chemical analysisProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Latvijos aplinkos, geologijos ir meteorologijos centras  
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimo, išvadų rekomendacijų bei  ataskaitos pateikimo paslaugosProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Žuvų migracijų intensyvumo stebėjimai dujų terminalo statybos poveikio zonoje 2014 m. sausio–vasario mėnesiaisProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: BMGS, AB Klaipėdos filialas 
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimo, išvadų, rekomendacijų bei ataskaitų pateikimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Pasvalio miesto tvenkinyje ir Lėvens upėje žemiau Pasvalio miesto tvenkinio 2014–2016 metais atliekami fizikinių-cheminių rodiklių, floros ir faunos tyrimai bei nustatoma minėtų vandens telkinių būklėProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Pasvalio rajono savivaldybės administracija 
Vandens lygio svyravimų poveikio žuvų ir vandens paukščių populiacijoms Kauno HE tvenkinyje įvertinimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: AB „Lietuvos energijos gamyba“ 
Skersnukio (Chondrostoma nasus) inventorizacija LietuvojeProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Lietuvos gamtos fondas 
Ungurių projekto mokslinių tyrimų paslaugos „Europinių ungurių (sidabrinio ungurio stadijos) mirtingumo migruojant Lietuvos vidaus vandenyse vertinimas naudojant telemetriją (2013–2014 m.)“ ir „Hidroelektrinių turbinų poveikio vertinimas, naudojant ženklintus ungurius, ir elektrinių turbinų parametrų vertinimas (2013–2014 m.)”Projekto vadovas: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
FA1304 Swimming of fish and implications for migration and aquacultureValdymo komiteto narys: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: COST 
Ungurių projekto mokslinių tyrimų paslaugos „Įveisimo efektyvumo vertinimas, stebint įveistų ungurių išgyvenimą, apsikrėtimą parazitais, augimo tempus, lyčių santykį (2014 m.)“Projekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos žemės ūkio ministerijos 
Nuodėgulinio ir juodažiočio grundalų paplitimo, poveikio ir gausos mažinimo studija Lietuvoje (GRUNDALAI)Projekto vadovas: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“ 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Mokslinių tyrimų Totorviečių tvenkinyje atlikimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Šakių medžiotojų ir žvejų draugija 
Mokslinių tyrimų Plinkšių ežere (Mažeikių r.) atlikimasProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Mažeikių rajono medžiotojų ir žvejų draugija 
Kuojos (Rutilus rutilus) žarnyno mikrobiota ir jos kaita dėl upių taršos poveikioProjekto vadovė: dr. Vesta Skrodenytė-Arbačiauskienė 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Ichtiofaunos tyrimai bei ekologinės būklės pagal žuvų rodiklius įvertinimas Lietuvos upėse ir ežeruoseProjekto vadovas: dr. Tomas Virbickas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Praeivių žuvų būklės tyrimai Lietuvos upėseProjekto vadovas: dr. Vytautas Kesminas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Aplinkos apsaugos agentūra 
Lietuvos Baltijos jūros aplinkos apsaugos valdymo stiprinimo dokumentų parengimasProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas 
GIS taikymas svetimkraščių vėžių invazijų vertinimui, biologinei kontrolei, vietinių vėžių apsaugaiProjekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“ 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Lašišos ir šlakio subpopuliacijų adaptacijos lokaliose sąlygose priklausomybė nuo genotipoProjekto vadovas: dr. Saulius Stakėnas 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Kormoranų poveikio Kuršių marių žuvų populiacijų struktūrai bei ištekliams vertinimas ir prognozė (KORMOD)Projekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Nacionalinės mokslo programos pavadinimas: „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“ 
 Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba 
Tvaraus Lietuvos jūrinių išteklių valdymo sistema panaudojanti modernius stebėjimo, modeliavimo metodus ir ekosisteminį požiūrį (NOR-FM)Projekto vadovas: dr. Linas Ložys 
 Padalinys: Žuvų ekologijos laboratorija 
 Užsakovas: Klaipėdos universitetas